В Восточно-Китайском море есть несколько островов, принадлежность которых оспаривается Японией, Китаем и Южной Кореей. Эти острова уже не раз становились местом вооруженных столкновений.
Япония, КНР и Китайская Республика спорят из-за островов Сенкаку, а Южная Корея и КНР — из-за острова Сокотра. Корейцы называют его Иодо и относятся к нему с суеверием. Местные рыбаки утверждают, что Иодо —место обитания морских ведьм, и сторонятся его. На самом деле это даже и не остров, а подводная скала, вершину которой от поверхности моря отделяют всего несколько метров. Она показывается из воды только в лютый шторм. Сейчас на скале установлена южнокорейская сейсмометеорологическая станция.
Ни одна из стран не желает идти на уступки в территориальных спорах, что объясняется главным образом наличием в приостровном шельфе громадных запасов нефти и газа. Попытки вести их совместную разработку зашли в тупик из-за непримиримых противоречий между сторонами.
Несмотря на то что система маяков и навигационного предупреждения в этих водах оставляет желать лучшего, судоходство здесь очень интенсивное. По Восточно-Китайскому морю идут морские пути из Жёлтого и Японского морей на юг, здесь же находятся крупнейшие порты мира: Шанхай, Нинбо, Вэньчжоу, Нагасаки, Цзилун.
Кроме минеральных ресурсов, Восточно-Китайское море довольно богато и ресурсами биологическими. В промышленных масштабах здесь ловят сельдь, сардину, камбалу, скумбрию. Ведется также лов краба, омаров, сбор трепанга и морских водорослей. Из морской воды добывается соль.
Однако экологическая обстановка в Восточно-Китайском море стремительно ухудшается. Массированное истребление биоресурсов и беспрестанное загрязнение моря промышленными отходами привели к тому, что 81% поверхности Восточно-Китайского моря относится к 4 - й степени загрязнения. Неуклонно снижается добыча всех видов морских ресурсов и сокращается число рыбаков.